С 2007 г. протоиерей Иоанн Тараканов был настоятелем храма святителя Николая Мирликийского на Рогожском кладбище, а последние 6 лет – почётным настоятелем.
По воле почившего, его отпевание было совершено в Петропавловском храме в Лефортове.
Надо отметить, что во все дни, пока тело усопшего находилось в храмах святителя Николая на Рогожском кладбище и святых апостолов Петра и Павла в Лефортове, над ним читали Евангелие священнослужители Петропавловского благочиния.
Накануне отпевания в Петропавловском храме был отслужен парастас. В сам день отпевания заупокойную литургию возглавил митрополит Валентин (Мищук). Чин отпевания совершил благочинный Петропавловского церковного округа архимандрит Алексий (Вылажанин). Его Высокопреподобию сослужили: архимандрит Стефан (Тараканов), заместитель председателя Синодального отдела по монастырям и монашеству; игумен Иоанн (Рубин), ректор Николо-Угрешской семинарии; протоиерей Александр Филимонов, клирик храма святых апостолов Петра и Павла в Лефортове; протоиерей Александр Тараканов, клирик храма Казанской иконы Божией Матери в Мещерском; протоиерей Тимофей Гонтар, настоятель храма Успения Божией Матери на Могильцах; протоиерей Андрей Орлов, настоятель храма святителя Николая Мирликийского на Рогожском кладбище; протоиерей Павел Гумеров, настоятель храма святых благоверных Петра и Февронии Муромских в Марьине; иерей Илия Тягин, клирик храма святых апостолов Петра и Павла в Лефортове; иерей Андрей Колганов, клирик храма Вознесения Господня у Никитских ворот; протодиакон Александр Моисеенко, клирик храма святых апостолов Петра и Павла в Лефортове; протодиакон Тихон Тараканов, клирик храма Сошествия Святого Духа на Даниловском кладбище; диакон Родион Ильин, клирик храма святителя Николая Мирликийского на Рогожском кладбище; диакон Симеон Тараканов, клирик храма иконы Божией Матери «Знамение» в Аксиньино.
Проститься со старейшим клириком Московской городской епархии пришли около 100 человек.
По завершении чина отпевания архимандрит Алексий обратился к собравшимся с надгробным словом в память о почившем.
Духовные чада также делятся воспоминаниями. Нина Базина, в частности, рассказала, что с батюшкой было хорошо молиться: «Когда он молился, все остальное просто забывалось. Было ощущение присутствия при разговоре с Богом. Простой в общении, великий и глубокий молитвенник…»
Почетного настоятеля храма святителя Николая Мирликийского на Рогожском кладбище г. Москвы протоиерея Иоанна Тараканова похоронили на историческом Введенском кладбище в Лефортове.
